在本来应该艳阳高照的夏天，临安地区居然会有大规模的冻死冻伤，可见当时明朝的气候已经达到了酷寒的地步。这样的天气对于农业生产也是毁灭性的，明朝晚期洪涝灾害、地震、蝗灾、海啸等等自然灾害不绝如缕。
《明史·五行志》为，罗列如下，以观其概。“万历十一年八月庚戌，河东盐臣言，解池旱涸，盐花不生。十三年四月午，因久旱，步祷郊坛……”这样极端恶劣的天气对于明朝子民来说已经成为了一种死亡的威胁，从易子而食到组装暴动，明朝的统治已经岌岌可危。
这样寒冷的天气使关外的女真部落也无可避免地受到了伤害，万历执政后期，由于气候和降水的变化，当时中国的温度已经降到了冰点以下，覆盖率了草原上的大量植被，冰面完全结冰，这对于以渔猎为生的游牧民族来说是非常致命的打击。
也正是因为这种极端寒冷的天气影响，女真人不得不进入明朝边境城市抢夺粮食和财物，以保证自己的生存。当时受灾严重的蒙古部落还和女真人一起进攻明朝“盟期间，蒙古国因无粮谷，屡至开原、铁岭掠粮。或粮而去，或被擒拿，夺其牲畜，凡有七八次，获牛计余。
历史上只要发生自然灾害，就会有流民遍地最终酿成起义的结局，农业的减产和连年的低温，导致农民颗粒无收甚至是家破人亡，他们已经到了铤而走险的地步，朝廷为了应对小冰期，在地方官员中进行裁员，导致一些本来就没有经济来源想在官府讨饭吃的小吏失去了工作，后来带领农民起义军*入北京城的李自成就是其中一员。
李自成的家乡陕西米脂是明朝受灾最为严重的地区之一，李自成此时既没有工作又无法吃饱，还欠了很多债，险些被县令打死。于是他忍无可忍，干脆起兵造反，最终打进了北京城，崇祯皇帝于煤山自缢而死。
除了因为气候原因导致的内部瓦解，小冰期气候也造成了外部的入侵。后金女真部落与明朝斗争了几十年，最终却在气候上略胜一筹，因为女真部落生活在寒冷的东北地区，所以对于环境的适应性要好于生活在温带地区的明朝。
在后金部队与明军的对抗中，据《明史》记载：“ 明年正月，以二月十有一日誓师，二十一日出塞……号大兵四十七万，期三月二日会二道关并进。天大雪，兵不前，师期泄”；“官兵四面围之，地泥淖，且时际穷冬，风雪裂肤，士无固志。”
可见寒冷的天气让明军毫无斗志，最终的失败也就不可避免。
综上所述，明朝小冰期极端寒冷的天气是其灭亡的主要原因，农民起义和外敌入侵只是次要原因，小冰期的寒冷，造成了整个明朝社会的恐慌，天灾人祸、流民匪患、外敌入侵都是因此而引起，最终导致了国家的灭亡。
而且小冰期不仅对明朝造成了极大的伤害，清朝也没能避免小冰期的威胁，从顺治年间到光绪年间，清朝和明朝一样，都是在寒冷的气候中度过的尤其是在晚清时期，长江中下游和东南沿海地区甚至出现了比明朝还要寒冷的天气，寒冷程度可谓是“前无古人，后无来者”。
