因为此事，蔡伦的地位节节攀升，公元八十八年，章帝病死于宫中，那位被窦皇后拐走的幼婴也十岁了，这名少儿名叫刘肇，继承了大统成为了新皇帝，史称汉和帝。皇帝年幼，升为太后的窦氏，顺理成章的成为了幕后真正的实权人物，蔡伦功不可没，自然被窦太后连连提拔，直到列为九卿，年俸2000石。
窦太后在十年后去世，蔡伦不仅没有因为后台的倒掉而身价立减，并且还投奔了新的主人，而这位主人是汉和帝的皇后邓绥。这位皇后在历史上记载是一位琴棋书画样样皆通的才女，虽然贵为皇后，百妃之首，却是一个俭节的人，写字画画的纸张，不舍得用帛纸，所以需要一种廉价但品质又不坏的纸。
此时蔡伦有了大显身手、发挥聪明才智的地方，得知才女皇后的这个愿望后，蔡伦毛遂自荐当上了皇家专用物品制造的官职尚方令，在以往的历史以来，这是第一次以九卿的身份担任这个官职，蔡伦借鉴了汉朝以来积累的制作纸张的方法，人们眼中的废物，比如破碎的棉布，烂棉麻，有了窟窿的捕鱼网，都成为了纸张的原料，而生产的纸张因为品质高，因此在东汉得到了全面推广，受到了皇家的赞赏。
古人常云，物极必反，造化弄人，历史充满了戏剧性。在公元一零五年，正是蔡伦造纸术发明的首年，才女皇后的夫君汉和帝驾崩了，邓皇后母子孤苦伶仃，怀抱里的幼儿也去世了，升为太后的邓皇后只能从皇家后代中重新选一个皇儿来做皇帝，而这位皇儿的身世却把蔡伦惊吓的魂魄都丢掉了，谁也料不到这位皇儿正是当年蔡伦操作下被贬到清河做诸侯王王的前朝太子刘庆的亲生儿子，当选为新皇的这位少年才13岁，名叫刘祜。
蔡伦心中翻江倒海，往事历历在目，将来的事情却不可卜问，但邓太后对这些事情却一无所知，蔡伦此时也再次升官，被封为“龙亭侯”，成为了公族的一员，食邑三百户，成为了名副其实的百户侯。不久蔡伦又当上了太仆，成为太后最值得信赖的人，蔡伦此刻一人之下万人之上，木秀于林，风必摧之，树大招风，蔡伦虽然知道自己位极人臣，但内心却小心翼翼。
天道轮回，种豆得豆，种瓜得瓜，邓太后在不久之后也撒手人寰，这时的皇帝刘祜（史称汉安帝）刘祜亲临朝政后，开始了对蔡伦的追罪，蔡伦当年在窦太后的指使下谋害其祖母宋贵人，迫使其生父太子之位被废。蔡伦遭到了革职查办，成为了罪人，蔡伦是一位很注重自己脸面的人，虽然自己办了坏事，但不愿遭到牢狱的侮辱，遂服毒自尽。
这位世界史上伟大的古代发明家蔡伦，就这样在公元一百二十一年于汉帝国的京城洛阳与世长辞。
