多样的职业系统
在三代中，还有一个新的收集物叫做小徽章，小徽章可以兑换一些实用的装备与道具。游戏中总共有着110枚小徽章，而玩家则需要去世界各地的每个小角落去搜寻。小徽章的收集并不是一个强制的系统，玩家即使是不收集小徽章也能正常通关。小徽章所奖励的装备也并不能算特别强力，但那些装备却有着一些有趣的效果。
系列中的昼夜系统也是在本作中首次出现，玩家在白天与黑夜在城镇中见到的人以及对话的台词都各不相同，在野外黑夜的怪物也明显比白天要强力。昼夜转换玩家无法控制，只能随着时间而转换，这也使得游戏更具真实性。
除了游戏中这些主要系统，本作中还有着许多的迷你游戏。例如散布在世界各地的大富翁场双六迷你游戏、游乐场中的怪物竞技场迷你游戏。每个迷你游戏都有着独特的玩法，并给予一些实用的奖励。虽然在二代中已经有了一个老虎机迷你游戏，但直到本作才有了正式的迷你游戏场所。
双六迷你游戏
《勇者斗恶龙3》可以说是JRPG游戏的代表之作，职业、昼夜、收集、迷你游戏等各种系统不仅仅是被自家系列所沿用下去，更是影响了许多其他的RPG游戏系列。而本作中所采用的存档系统更是使用了当时最为先进的“电池存档”，这一存档机制当时还被《最终幻想》作为卖点所宣传。电池存档使得玩家不用再去记下繁琐而且过长的密码，只需按下存档选项即可保存游戏所有数据。
本作的销量高达385万套，成为了日本销量最高的第三方FC游戏。游戏发售日在当时定在了工作日，许多学生与工人都翘课翘班去秋叶原排队购买游戏，各个游戏商店门口都有着叹为观止的排队现象，而一些人也乘着混乱试图抢劫与偷窃。这种混乱的社会现象还导致政府作出了让《勇者斗恶龙》系列只能在周末发售的规定。
发售日盛况
《勇者斗恶龙3》的巨大成功让这个系列正式成为了日本的“国民游戏”。本作给ENIX公司带来了高额的利润，与此同时堀井雄二也成为了著名的游戏制作人。
堀井雄二
在系列最新作《勇者斗恶龙11》的结局CG里还能看见在三代中开头的那句话：“孩子，今天是你的16岁生日，国王想要见你。”由此可见，无论是在系统还是在剧情上，三代都有着最为重要的地位，也是系列的一个巅峰。当然，《勇者斗恶龙》系列的进化还远远不止这些，“洛特三部曲”的结束只代表着这个系列的开始…
