1994年，福清市在遗址上重建南少林寺，各界人士及海外华侨慷慨解囊，集资5000万元用于重建，2001年国庆节，福清南少林寺景区正式开放。
南少林寺先后兴建了牌坊、山门、天王殿、大雄宝殿、达摩祖师殿、钟鼓楼等建筑，寺院墙基均为白色，墙壁、门户、梁柱均为红色，屋檐红白相间的仿古斗拱、椽条，在金黄色琉璃瓦辉映下，显得庄严肃穆，使千年古刹重现当年雄姿。
四、莆田南少林寺
莆田南少林寺位于福建省莆田县西天尾镇九莲山林山村，距市区约17公里。九莲山海拔500多米，寺区周围有朱山、樟江、寨头等10多个山寨，少林寺遗址正处在九莲山盆地的中心。
