噬菌体是哪里产生的,噬菌体是从哪里来的

首页 > 体育 > 作者:YD1662023-10-31 07:05:22

模块化结构

Thrax1-5 噬菌体具有 157-169 kb 的大型线性基因组,编码 233-268 个 ORF,其中约 70% 编码假设蛋白,以及 6-22个tRNA。

基因组特征性地组织成功能模块,其中两个更突出的模块编码,参与病毒粒子形态发生和裂解,以及复制和核苷酸的基因代谢

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病毒体形态发生和裂解

左臂包含 32 个(Thrax1-3)或 34 个(Thrax4-5)正向转录基因,其中大部分参与宿主细胞裂解产生、包装和释放噬菌体子代颗粒。

DNA 包装模块由臂中的前两个基因组成,在 Thrax1-5 中非常保守(分别编码末端酶小亚基和大亚基)。

末端酶对于将噬菌体 DNA ,包装到噬菌体头部是必不可少的。作为一种酶复合物,小亚基决定了 DNA 结合的特异性,而大亚基介导噬菌体 DNA 的切割和包装

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通过 NCBI 保守域数据库 (CDD),这两个基因都缺乏可识别的保守功能域

小亚基的预测基于它的基因组位置、轮廓隐马尔可夫模型 (HMM) 与已知 DNA 的相似性限制性核酸内切酶,和 DNA 结合蛋白,与大肠杆菌T4 噬菌体末端酶小亚基中,显示的 DNA 结合功能一致。

在其他酪氨酸病毒组噬菌体之外的,大亚基与乳球菌的末端酶。大亚基具有最高的相似性GenBank 上的 av949 样噬菌体,和轮廓 HMM 与 T4 噬菌体中末端酶大亚基的相似性。

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我们已经分离出,五种感染炭疽病原体炭疽杆菌的噬菌体

使用现代系统发育方法,我们将这五种新的芽孢杆菌噬菌体,以及从公开可用的数据库和宏基因组数据集中,检索到的 21 个相似的噬菌体基因组。

归入 Tyrovirus 组,这是一个新提出的组,由于三种不同的酪氨酸*酶的保护而得名。

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