其实，她的古DNA研究之路并非一帆风顺。本科就读文物保护技术专业、硕士期间专攻骨骼研究的付巧妹，在前往德国时可以说完全是古DNA研究上的门外汉。为了获得读博的可能，大量阅读文献、做实验成了家常便饭。这段经历让她一个月瘦了20斤，也让她在逆境中快速成长。
2017年，基于中国四万年前的田园洞人基因组，付巧妹为东亚人群古DNA研究打开局面，揭示了东亚史前人群的多样性及遗传历史的复杂性，也突显出对东亚更多不同时期、不同区域的人类样本进行采样研究的迫切需求。
2020年，通过大规模捕获测序中国南北方人群的古基因组，付巧妹逐步揭开了东亚，尤其是中国史前人群南北格局、迁徙扩散及遗传混合历史的面纱。
弄清“我们是谁、我们从哪里来”，依旧是付巧妹在有生之年致力解答的问题。尤其是从青藏高原的“土”中提取出丹尼索瓦人的首例DNA后，付巧妹期待能够在未来的探索中找到东亚人自己的、特有的古人类，以填补东亚古人类遗传历史上尚存的空白。她期待有一天能够用古代人类遗骸的DNA书写中国人群自己的遗传历史，为绘制全球人类演化谱图作出中国贡献。
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