蓝色，一种自然界中最稀有的色素，也是动物界中较为罕见的颜色。虽然天空和海洋是蓝色的，但动物界中却几乎没有蓝色的存在。这是因为在动物界中，能够产生蓝色色素或吸收食物中蓝色色素的能力相对较少。相比之下，黑色素和类胡萝卜素在动物中更为常见，分别呈现出棕黑色和红橙色。而蓝色在动物中的出现通常是由结构效应和选择性反射所引起的。因此，蓝色的稀有性使其更加神秘和难以捉摸。
冠蓝鸦冠蓝鸦产生黑色素，这意味着它的羽毛应该是黑色的。然而，鸟羽中微小的气囊会散射光线，使它们在我们的眼中呈现出蓝色。冠蓝鸦羽毛内的光线散射现象与瑞利散射非常相似，正是这种现象解释了为什么天空是蓝色这个古老问题。
因此，由于蓝蓝鸟羽毛独特的蓝色并非由色素引起，通过改变它们的结构可以将鸟羽的颜色变回黑色。实际上，受损的蓝蓝鸟羽毛在光线散射受到干扰时会呈现出黑色，因为所有蓝色的痕迹都会消失。
蓝岩鬣蜥是特有于大开曼岛的一种蜥蜴，寿命较长，可活到69岁。刚出生时，它们的斑纹复杂，但几乎没有蓝色，只有身体的一些部分呈淡蓝灰色。随着它们的成长，它们的颜色变得更蓝。然而，成年蜥蜴有能力改变颜色，通常会使自己变成灰色，以便与栖息地中的岩石融为一体。
只有当蓝蜥蜴与同种其他个体接触时，才会变成蓝色。该物种的雄性通常比雌性具有更明显的蓝色。
大西洋海神海蛞蝓是一种奇特的裸鳃类物种，就像许多其他裸鳃类一样，它以其鲜艳的色彩而闻名。这种物种倒挂在水中，以危险的葡萄牙水母(Physalia physalis)为食，后者以其具有毒刺的恶名而闻名，这些毒刺可以*死鱼类，有时甚至可以*死人类。大西洋海神海蛞蝓的蓝色充当了一种伪装，使海蛞蝓能够与海洋的蓝色融为一体，使飞越水面的海鸟等捕食者很难发现它。
如果蓝色伪装还不够保护，这种海蛞蝓还能够吸收它所吃的葡萄牙水母的毒刺，并将其用于自身的防御或捕食猎物。
花斑连鳍是来自太平洋的一种色彩鲜艳的鱼类，其蓝色是由细胞色素而不是结构色所产生的。花斑连鳍的皮肤含有称为青藻细胞的细胞，其中含有产生蓝色色素的细胞器称为青藻体。然而，青藻细胞并不是鱼体皮肤中唯一产生色素的细胞，这就解释了它们身上装饰着橙色条纹的原因。明亮、多彩的图案，使它们成为是水族馆中受欢迎的鱼类。
