但是王敏佳的真性情为她带来灾难，她为老师打抱不平所写的信，被认为是破坏他人家庭。
陈鹏所关心的，最初只是完成学业，进入科研所工作。对王敏佳，最初有一些朦胧的暗恋，但种种遭遇将二人的命运紧紧相连，让二人的感情得到升华。
王敏佳被批斗毁容，故事的最后，只留下一个意味深长的眼神，和一句深情的话“死亡来临前，我一定要找到你。”
当王敏佳面裹长巾沿着铁轨一路流浪，陈鹏在归家的火车上看着自己掉落的头发，他们也许会回想起牵手在清华园奔跑的那个浪漫的下午。
美好的年华留不住，但至少他们留住了对彼此的深情。
这是属于他们的“无问西东”。
时间来到当代，在繁忙拥堵的城市，张震饰演的张果果是广告公司的精英，作为高薪阶层，却在职场争斗中越陷越深。但他心底始终保有一份奉献精神，无私地帮助四胞胎家庭度过难关，而不去计较得失。
这是属于张果果的“无问西东”。
电影的主人公们，在不同的年代，面临着不同的问题，但他们之间有一种冥冥之中的关联。
这种关联首先是，他们清华学子的身份，是百年清华精神的延续和传承。正如校歌“立德立言，无问西东”，校训“自强不息，厚德载物”所写的那样，电影中的几位主人公，身体力行，用自己的选择践行了这些话的意义。
电影结尾以致敬的方式，列举清华大学校史上的数位大家，他们同时是20世纪中国最伟大的人物。他们并非高官，也非富商，而是在文史哲数理化领域做出突出贡献的学者。冯友兰、钱穆、杨振宁、陈寅恪、邓稼先……他们也以配角的身份出现在电影中。譬如在西南联大简陋教室中“静坐听雨”的一场戏，艰苦的环境挡不住学生们求学的热情，其中就有当时16岁的杨振宁。
