余杭县
三是钱宝生就是钱坦吗？
钱宝生在当时的仓前镇根本就没有此人，只是在杨乃武遭到刑讯逼供时随意顺口编造的一个人名。刘锡彤派人到仓前镇把钱记“爱仁堂”钱老板找来，钱老板说他叫钱坦，他的药铺没有叫钱宝生，而且他与杨乃武、小白菜素不相识，他的药铺也是小药铺，从不卖砒霜，这都是有账可查的。
刘锡彤不管钱坦说的这些，为了致杨乃武于死地，他威逼利诱钱坦承认他就是钱宝生，并承认曾经卖过砒霜给杨乃武。钱坦为了能早日回家做生意，就被迫答应了刘锡彤的要求，谁知该案一再反复，钱坦无法摆脱干系，一直被关于狱中，最后冤死（当时许多人认为他是被*人灭口）。
杨乃武觉得钱坦虽然做了伪证，但都是因为他被牵入此案，最后冤死狱中，故心中对钱坦一直怀有歉意。杨乃武出狱后一直做蚕桑生意，每当途径仓前镇时都要去钱家看望，并为钱家“爱仁堂”药铺写了一副对联：
名场利场，即是戏场，做得出满天富责；
寒药热药，无非良药，医不尽遍地炎凉。
四是涉案有罪被革职查办的官员究竟有多少？
在很多戏曲和影视剧等文艺作品中，都说此案的涉案官员有三百多人，有罪被革职查办、摘去顶戴花翎的有一百多人，事实上并非如此。根据光绪三年（公元1877年）二月刑部定案奏折及谕旨，仅有十名涉案的有罪官员受到革职查办。其中蒯贺荪在结案前已经亡故，实际上受到处罚的只有九名官员。
杨乃武与小白菜奇案展示馆
五是慈禧太后借此案打击湘军出身的官员，遏制曾国藩的势力。
有种说法是在晚清张汶祥刺马案中慈禧太后吃了亏，去调查曾国藩的两江总督马新贻被刺*是湘军暗中策划。这次正好借杨乃武与小白菜一案打击湘军势力，巩固满清统治，这个纯属阴谋论说法。因为出身湘军的杨昌濬被革职后不久就复官了，还被擢升为闽浙总督，从一名革职罪官一跃成为封疆大吏，这完全看不出是要打击遏制湘军出身的官员。
杨乃武与小白菜一案完全是因为晚清政治腐败，官场贪污成风，官官相护，视老百姓生命如同儿戏，滥用职权，刑讯逼供所致。罪魁祸首刘锡彤为一己之私，挟私报复，草菅人命，最后也在古稀之年死在流放之地黑龙江，可谓是罪有应得。
除此之外，上海《申报》对此案的跟踪报道，也对案件的真相大白起到了积极作用。当时京城官员都有订报的习惯，上海《申报》对案件的及时报道和客观评价，使此案在社会上形成了一定的社会话题，充分发挥了舆论监督的作用。
