被关进红莲寺后，方世玉一直想尽办法脱身，试图带着少林弟子一起推翻神公的统治。
没想到，自己的师兄洪熙官（杨升 饰）也在这里，而且还成为了神公的手下、助纣为虐。
危急关头，方世玉想要干掉神公，却没想到对方是个绝顶高手。
不仅把他打成重伤，还命人将其扔进井里。
更令他没想到的是，在这里他遇见了少林寺的智善大师。
另一边，神公察觉到洪熙官可能是假意投降自己，目的是想要盗取红莲寺的机关地图。
洪熙官见事情败露，带着少林弟子在智善大师的带领下，从井里的暗道逃出。
后来，火药库被引爆之后，红莲寺的主体结构也被破坏。
方世玉和洪熙官合体，联手使出了“虎鹤双形”与神公展开厮*。
虽然神公武功高强，但是双拳难敌四手，最终惨败。
此后，红莲寺不再存在，少林弟子也重获新生。
二、不可多得的经典翻拍
风格犀利的林岭东，与“鬼才”徐克联手，让新版《火烧红莲寺》备受期待。
老版《火烧红莲寺》，虽说故事和特效不足为奇，但是在当时看来，片中的剑光斗法、飞天遁地、掌心吐雷的场面，绝对震撼人心。
而林岭东的作品，则是一部充满黑色、诡异、恐怖氛围的武侠动作电影。
