但是，华伦认为他们家算是上层家庭了，应该都很讲卫生才是，所以他纳闷地请来了医学专家索柏进行调查，最终索柏的目光锁定在了健康的玛丽身上。在追查玛丽的任职情况时，他发现她之前供职的8户人家中就有7户人家曾出现过有人感染伤寒的情况，一共24人罹患伤寒症。并且观察到玛丽有不洗手的坏习惯后，索柏更加确定了伤寒的传播跟玛丽息息相关。
但玛丽却从来没出现过伤寒的症状，这让索柏理所当然地怀疑玛丽可能是一名病菌携带者，尽管她可能已有抗体不会发病，但是却依旧能够传染他人。因此他尝试与玛丽沟通，希望她能留下自己的粪便样本以进行化验。可是玛丽没读过什么书，对"无症状感染者"这个新概念更加理解不得，她认为这种要求是在侵犯自己的隐私，便严加拒绝，甚至拿叉子将索柏赶出了她家。
仅仅在那一两年里，美国纽约就出现了三千多例伤寒患者，情况实属恶劣，而索柏认为这个源头便是玛丽。为了能够尽早阻止病毒继续肆虐美国，索柏向卫生部申请成功，携警察强制要求玛丽留下了粪便样本。化验结果出来后，不出索柏所料，呈阳性，玛丽"无症状感染者"的身份证据确凿，最终于1907年玛丽被强制带到北兄弟岛上进行隔离。
隔离的两年中，玛丽安分地接受了一共162次的检测，而其中120次依旧呈阳性，她还接受了一些治疗，可一直没有起效。终于玛丽爆发了，她洋洋洒洒地写了一篇控告卫生部门侵犯她人权的文章，并刊登在了1909年6月的《纽约美国人报》上，打动了当时大量的民众。这迫使健康委员会考虑解除她的隔离，但给了她两个选择，一是摘除聚集着病原体的胆囊，二是不再成为厨师，因为她没有好的卫生习惯。玛丽想都没想选择了第二个，就离开了隔离医院。
