到了俄国内战时，苏俄为尽快退出一战选择与德国签署《布列斯特和约》，给盟军带来颠覆性的战略影响，盟军就此转向支持白军。而白军对摩尔曼斯克的战略意义十分清楚，因此联合盟军从占领摩尔曼斯克开始掣肘苏军。此战英国投入士兵1.3万人、美军4000人、法军2000人，另有奥林匹亚号巡洋舰、护卫舰等十多艘战舰参战。
德国在1918年11月战败签署停战协议，苏俄次日便宣布废除《布列斯特条约》，但此举不被盟军认可，至此进入270万苏军对抗240万白军和70万外国干涉军的俄国内战期。
五年内战导致190万苏军和近千万平民伤亡，摩尔曼斯克虽然位置偏僻，但双方争夺战却从头到尾从未中断，新建的海军基地、港口和铁路公路被轰炸的面目全非，直至英法联军全线撤离后才逐步稳定，但苏军直到1922年赶走日本干涉军后，才敢放心的公开宣布摩尔曼斯克已经解放。
为了不重蹈内战覆辙，苏联准备在此设立西北工业中心，历经四年建造于1937年在摩尔曼斯克成立北方舰队总部，并一口气将其扩张成苏联五大舰队中规模最大、实力最强的海军舰队，巅峰期共拥有15艘潜艇、8艘驱逐舰、7艘巡洋舰及破冰船等辅助舰艇共200多艘，还有400多艘运输舰（总吨位超百万）、1300架歼击机随时待命。
