3DS 拥有两个世代共 4 部正统宝可梦作品，分别是正传作品《精灵宝可梦 X / Y》和《精灵宝可梦 太阳 / 月亮》、复刻作品《精灵宝可梦 阿尔法蓝宝石 / 欧米茄红宝石》和资料片《精灵宝可梦 究极之日 / 究极之月》。自 X / Y 开始，宝可梦系列正式步入 3D 化，传统的像素风被全新的立体 5 头身人物取代，建筑、草地等也都拥有了 3D 建模。
步入 3D 化之后，宝可梦在玩法上也有了不小的变化。比如从 X / Y 开始的每代宝可梦都会为对战加入新的要素，比如 Mega 进化（X / Y）、Z 招式（太阳 / 月亮）、极巨化（剑 / 盾）和太晶化（朱 / 紫）。
在《X / Y》中，部分宝可梦佩戴相应的 Mega 石即可在对战中进行 Mega 进化。进化后的宝可梦在各项数值上都有飞跃性的增长，甚至能够获得第二种属性。另外，该作也加入了一个全新的宝可梦属性——妖精，一个为了克制龙系而引入的新属性。
到了《太阳 / 月亮》，除了宝可梦游戏首次官方支持中文外，还在游戏机制上做出创新，取消了之前的道馆，改为了符合世界观的「诸岛巡礼」与「大考验」。通过岛屿的所有关卡后，将与一个巨大的霸主宝可梦对战，然后即可挑战岛主，完成一个岛屿的「巡礼」。并且还引入了地区形态的的机制，部分宝可梦会因为生活地区而有不同的形态。比如六尾和九尾在阿罗拉地区就会拥有白色皮毛，非常好看。
3DS 的宝可梦系列无法全程开启 3D，尤其是在《太阳 / 月亮》里，3D 功能几乎成了一个添头。不过游戏在玩法上充分利用了双屏，比如《太阳 / 月亮》里就可以通过下屏与宝可梦互动，增加亲密度。
我不是个宝可梦重度玩家，单纯只是为了收集我喜爱的宝可梦。同时也有着回忆童年的成分在里面。小时候也是为了收集好看、可爱的宝可梦，现在我也是在收集好看、可爱的宝可梦。不求集齐，但求好看！请雷丘、胖丁这样的宝可梦多来点！而且在与宝可梦进行爱抚环节的时候，宝可梦每一次微笑和雀跃都仿佛我在猫咖撸猫，颇有种赛博撸猫的感觉在里面了。
来吧！动物森友会（动物之森：新叶）与 Switch 平台的《集合啦！动物森友会》移居无人岛的设定不同，在 3DS《来吧！动物森友会》里，我们将乘坐火车到一个村子里上任村长。游戏的核心玩法与《集合啦！动物森友会》相同，玩家只需要按照自己的想法经营好村镇即可。我们可以自由穿梭于村镇和商店街、与小动物们培养感情，在商店街尽情购物。
