目前对于小瓜虫病的防治尚无特效药，须遵守防重于治的原则。清除池底过多淤泥，水泥池壁要进行洗刷，并用生石灰或漂白粉进行消毒。对于池塘、育苗室养殖水域，加大换水量，改善水质，定期消毒。育苗室用具经?常用福尔马林或高锰酸钾进行消毒，并做到专池专用。鱼下塘或进入网箱前应进行抽样检查，若发现多子小瓜虫应及时采用上述方法治疗。放养密度不宜过大，日常应加强营养，提高鱼体抵抗力。
设计和制作网箱渔排时，其分布要合理规划和布局，密度适宜。平时可每月调整网箱设置区域一次，勤刷洗养殖网箱，保持网箱水流畅通。每15d定期用生石灰泼洒或强氯精挂袋，以保证养殖区内水体的水质良好。
小瓜虫的生活史中，只有那些基本成熟、即将脱离鱼体或刚脱离的滋养体和掠食体才对药物敏感，而在滋养体的早期、中期和包囊体中幼虫均对药物不敏感。因此，一种即使对虫体很有效的药物，都需要连续使用3-7个疗程，才能完全*死虫体，两疗程之间间隔一定的时间，间隔期的具体长短视水温而定。最适温度（24-26℃）时需隔天1次治疗1周。评定药物的治疗效果，需要在3个疗程之后，根据在显微镜下检查鳃丝中有无虫体或虫体是否死亡来判定。同时决定是否继续进行更多的疗程治疗。
当环境不适，特别是低温时，小瓜虫成虫并不立即形成胞囊而先分裂，有的中途死亡，有的分裂到一定数目中途再产生胞囊或不形成胞囊。而在高温时，胞囊内孵出幼虫所需的时间随温度升高而变短，囊壁厚度随水温升高而变薄。所以温度升高或者降低都是控制病情的有利因素。小瓜虫对外界渗透压十分敏感，所以要好好利用这一特性。利用食盐刺激小瓜虫离体之后再*灭离体小瓜虫也是一个非常好的治疗办法。
被推荐用于食用鱼白点病的治疗药物主要是福尔马林、硫酸铜（或络合铜）和高锰酸钾三种，市场上流通的此类药品拜特辛敌磷与拜特超铜?合用比较有效。拜特超铜主要成分是萘酸铜40%、活化剂和渗透剂。拜特辛敌磷成分是4%敌百虫、4%的辛硫磷及增效剂。原理是利用小瓜虫在外界渗透压变化之后会离开鱼体，而硫酸铜可以有效*灭游离在水体中的小瓜虫。在治疗的几种方法中，此种方法非常快速有效。
能否有效控制小瓜子虫暴发有一参考标准，鱼是否还保持吃食！只要鱼还有采食功能就有通过内服抑虫的药物达成控制小瓜子虫的目的。尤其是网箱养殖的品种，必须在易感季节投喂防虫药品才是最佳手段。
投喂药物及方法：计算好鱼的体重，评估好小瓜子虫的感染率，观察鱼的死亡及体质情况，用虫虫草及纤虫拌料内服。
小瓜虫侵入鱼的皮肤或鳃组织后，引起组织增生和发炎，并产生大量的黏液，形成白色囊疱。病鱼反应迟钝，游于水面，不久即死。防治： 发病鱼塘，每亩水面每米水深，用辣椒粉210克、生姜干片100克，煎成25公斤溶液，全池泼洒，每天1次，连泼2天。每立方米水体用亚甲基蓝2克化水全池泼洒，每隔3天泼洒一次，连泼3次。
多采用小瓜虫不耐高温的弱点，提高水温，再配备药物治疗，通常治愈率可达90%以上。若治疗及时，治愈率可达100%。用百万分之二十五(25ppm)的甲醛溶液；也可用1%盐水浸泡数天，或用百万分之二(2ppm)的甲基蓝溶液，每天浸泡6小时；或用28——30℃的百万分之二(2ppm)的盐酸奎宁药液浸泡3——5天，或用百万分之二(2ppm)的硝酸亚汞药液浸泡30分钟；或用百万分之五十至七十(50——70ppm)浓度的红汞溶液浸泡5——15分钟，或用百万分之零点一至零点二(0.1——0.2ppm)的硝酸汞溶液泼洒，均可取得良好效果。
小瓜子虫可防可治，不可怕。树立信心，坚持内服管理及稳定水质，不滥用外用*虫剂破坏水质影响体质是关键。
冬季，当水温在15℃——20℃之间时，淡水白鲳幼鱼易患小瓜虫病，病鱼体表出现大量黏液，严重感染时，在水中呈白云状。防治：鱼种进池前，镜检鱼的体表及鳃，发现有小瓜虫时，用5%的食盐水浸泡3分钟——5分钟。
越冬鱼苗大多数在入冬初期易患细菌性烂鳃病，开春前患寄生虫引起的鱼病，水温15℃——25℃时患小瓜虫病或擦伤鱼体后患的水霉病等。
1.预防措施：①小心操作，尽量减少鱼体受伤。②鱼苗过数、转塘时用0.5%——0.6%的食盐水浸洗鱼苗10分钟——15分钟或每立方水用0.1克的高锰酸钾溶液浸洗鱼体5分钟——10分钟，然后再放入池塘。③每隔20天——30天，用生石灰全池泼洒一次，用量为每亩均1米深用15公斤——20公斤，兑水全池泼洒。④用茶麸(整块、不宜打碎)每亩水面，深均1米用7公斤——8公斤，置于池塘四角和中间，让其慢慢溶解，起消毒和调节水质的作用。
2.小瓜虫病：流行于水温15℃——25℃时，病状：病鱼游泳迟钝，浮于水面，有时集群绕池，检查病鱼鱼体，鳍条、鳃部有许多小白点。此时，每亩水面均1米可用半斤干辣椒和2两干姜片，用4斤清水煮沸后熬半小时，然后连渣带汁全池泼洒，连续2天，每天一次，可达到预期的效果。
患病鱼体色发黑，消瘦，浮于水面或游动迟缓，多数病鱼体表有一层白色黏膜覆盖，鳍条缺损。取样送实验室检查，病鱼体表、鳍条和鳃布满白色点状包囊，少数病鱼眼角膜上也有小白点，用小镊子取下包囊放在玻片上进行显微镜观察，虫体呈圆形或球形，可任意变形和不断转动，当游动较慢时容易看到虫体有一个马蹄形的核，可看到10——20多个虫体，甚至更多，根据寄生虫的特点即可判断为小瓜虫病。
治疗方法：全池泼洒复合亚氯酸钠粉（商品名：鱼菌清2号）进行水体水体消毒，用药量：每亩平均水深1米用绿袋和白袋药各一包分别溶水，然后将两种药液混匀，放置8分钟——10分钟后加水30千克全池泼洒。待泼洒3个小时后，再用青蒿末和*虫王混合泼洒，每亩平均水深1米用青蒿末150克和*虫王30毫米。用药后虫体基本脱落，如要加强效果，隔天再用一次。
在精养鳗池水源前建一口蓄水池和一口白苗培育用的调温池，防止野生鱼类和下暴雨时的混水等进入养殖池。进水口要安装过滤膜，虽然过滤膜尚不能阻隔虫体的直接进入，但它能够防止携带虫体的野生鱼类进入，鱼塘灌满水之后，至少要自净3天以后才能放入鳗苗，因为即使随水源引入幼虫，在它们没有找到宿主感染时，两天后会自行死亡。
曾经发生过小瓜虫病的鱼塘，要进行深翻冲洗或换新沙石并整平，要彻底清塘、干塘、撒生石灰(200Kg/亩)，并且在烈日下曝晒一周，冲洗干净，然后用高锰酸钾30——50ppm，浸泡3天。池壁和进水渠道等也要冲洗干净，放水待3天后放苗种。
白苗和黑仔培育，有条件的最好用地下水，苗种培育时最好要设调温池，水温调到30℃以上，可控制小瓜虫病传入养殖池。
每个管理工人要规定管理几口渔池，在两个池子的池边接合部要放一个消毒桶，用100ppm的高锰酸钾消毒排污、脸盆、网具等。每进入一口池都要对工具进行消毒，管理员用脸盆装高锰酸钾消毒液冲洗穿在身上的水裤后才进入另一口池工作。
没有地下水的渔场，若遇暴雨，要及时关掉水源，1天后待水源清洁才能放水，否则很容易暴发小瓜虫病。
在生产管理中，若发现鳗鱼吃不好，要及时捞出比较差的鳗鱼进行诊断，一般鳃部比较容易感染小瓜虫病，若皮肤感染严重时比较难治。小瓜虫病要提早预防，及时治疗。
从健康养殖来说，目前没有特效药来*死小瓜虫，但可通过以下操作来进行缓解和治疗。
2．彻底排污消毒，水位排到625px,关掉增氧机排污，到水位10——375px加注新水，插上排污管，待水位625px，开启增氧机。水位30——875px时停止注水，然后下海中宝3——5ppm。
3．病情较轻时死亡鳗鱼数量少，一般每口养殖池塘3——5尾，可先采用高锰酸钾2ppm，消毒时间6——8小时，大量换水，排污连用2——3次，然后用海中宝＋戊二醇＋抗菌药连用2——3次，含氯消毒剂3——5次，可达到一定的治疗效果。
4．病情严重时，用3——5‰粗盐，然后用戊二醇1——2ppm或福尔马林40——60ppm，浸泡24——36小时后排污，捞掉死鳗，排污10——375px或全部换水，重新加药或补充药物，连用2——3次，再用含氯消毒剂连用3——5次，可达到良好的治疗效果。
5．每立方米水体用大黄1.5克，野菊花干品1.5克，煎汁全池泼洒，连用3天，可*灭小瓜虫。
6．用硫酸镁1.5%和食盐3.5%的混合液浸洗病鱼5分钟，可将小瓜虫全部*死。
7．用土荆芥29%、苦橡叶43%、野芋叶14%、紫花曼陀罗14%,混合煎汁至原药量的2倍，给病鱼浸洗，可*死小瓜虫。每隔3——4天泼洒一次，连续3——4次，能完全*灭小瓜虫。
①发现病鱼及时捞出隔离治疗，并用生石灰彻底消毒水体。②在彩用市售*虫药物进行药饵治疗效果不佳情况下，采用中草药治疗，每箱用辣椒和生姜按2：1比例煮水泼洒，每亩采用干辣椒1000克、生姜500克煎煮成20千克汁水泼洒，连续三天，效果十分明显。用药量可根据病害的严重程度增减。③采用氯*王治疗烂鳃等细菌性疾病，每亩200克，每日一次，7天为一个疗程，病情基本控制。
