庆历八年（公元１０４８年）的闰月恰好在正月，当年就有了两个正月十五元夕节。第一个元夕过后，宋仁宗准备在闰正月的十五再张灯结彩办一次灯会。曹皇后得知后，以靡费和无法保证安全为由劝阻仁宗取消了这次灯会。
过了三天，有几名卫士发动叛乱，他们趁夜黑穿越前殿，直奔仁宗寝宫而来。当时曹皇后正在侍奉仁宗，仁宗想出去逃跑，被曹皇后抱住全力劝阻，仁宗听从劝告，没有出去。叛乱时，内外情况不明，贸然出去，万一遇到叛军，后果不堪设想。曹皇后的思虑周到，做法堪称明智。
曹皇后随即命令关闭了寝宫的殿门，并迅速派人传召负责宫廷禁卫的都知王守忠，让他尽快前来平叛。这时叛乱的卫士击伤一名侍女，侍女大声惊叫，声音传到寝宫。有内侍假意来禀报说是乳媪在殴打小宫女，曹皇后厉声训斥他道：“叛贼就在旁边*人，你们还敢这样胡说！”
她预料到叛军一定会放火，就派内侍宦官端着水盒悄悄跟在叛军身后。叛军果然用火把点燃了门帘，待他们走后，悄悄跟在后面的宦官，马上用水浇灭了火种，让叛军焚烧宫殿的想法未能得逞。
当晚曹皇后每派出一人出去办事前，都要亲手剪下他的头发，告诉他们说：“明天就以头发作为凭据来论功行赏。”因此，人人争先效力，叛乱很快就被平息了。
发生叛乱时，内外情况不明，贸然出去，万一遇到叛军，后果不堪设想。曹皇后思虑周到，劝阻仁宗外逃的做法堪称明智。另外，在整个事件的处置中，曹皇后心思缜密，坚决果断，表现出了超人的镇定及非凡的统御力和判断力。
叛乱平息后，寝宫内一名宫女与叛军私通，按律应该处死，宫女找到深受仁宗宠幸的张贵妃替她求情。仁宗答应了张贵妃的请求，赦免了那名宫女的死罪。曹皇后得知后，穿着正式朝服去见仁宗，要求按律处置，并说：“不这样的话，就没办法整肃宫掖了！”。仁宗让她坐下说话，曹皇后坚持不肯，要求仁宗尽快下令。这样僵持了一会，仁宗被迫应允，马上处死了那名宫女。
不过这件事也激起了仁宗的猜疑，仁宗怀疑这是她为了邀功，自导自演出的一幕闹剧。态度开始急转直下，对她变得极度不信任。按《宋人轶事汇编》记载，仁宗曾对宰相说：“我在宫中，左右都是皇后的党羽！”。另一次又对宰相梁适说：“我想废黜皇后怎么样？”梁适说：“市井小民都不会轻易休弃自己的妻子，陛下是万乘之主，废黜皇后这样的事怎么能连做两次呢？”。
后来，仁宗心情稍好了一点，有一次闲聊时告诉曹皇后说：“我曾想过要废黜你，幸亏梁适进谏，你才幸免于难！”。曹皇后心里非常感激梁适，梁适去世后，曹皇后曾花费五百万钱做法事为梁适祈福，仁宗见了过问此事，曹皇后据实以告，仁宗长声叹息，却并未阻止。曹皇后于是每年都做此法事，引为定例，直到她去世后才停止。
嘉佑元年（公元1056年），仁宗得病，神志有些错乱，恍惚中竟然觉得曹皇后会谋害他，于是就在宫中叫喊：“皇后与张茂则谋大逆。”张茂则是负责服侍仁宗宦官，听闻后吓得想去自*，被人救下，曹皇后从此也不敢再到仁宗跟前去伺候他了。
仁宗对曹皇后的不满，其实深层次的原因还是在于两人的结合是出于政治婚姻，并无感情基础。加上仁宗就感情而言，更加亲近贵妃张氏，并不喜欢曹皇后，因此，不管曹皇后如何表现，在仁宗眼中，总有不是之处，这也是曹皇后的悲哀。
仁宗以无嗣的缘故，将年方四岁的英宗赵曙接入宫中抚养，立为皇子。曹皇后对他视为己出，尽心抚育，对他非常慈爱。仁宗暴病身亡后，曹皇后和大臣们扶持赵曙继位，史称宋英宗。英宗登位后，尊奉曹皇后为皇太后。
英宗有一次得了重病，不能处理政务，为防备大权旁落，便请求太后帮忙处理政务。太后答应了英宗的请求，来到东门小殿垂帘听政。因为她熟悉五经及史书，听政中多以经史中的道理来判断是非，故而很少犯错。听政期间她严格约束自己的娘家曹氏和自己身边的臣仆，不让他们肆意妄为，因此，朝廷上下政治环境秩序井然，没有出什么大的乱子。到了夏天，太后马上下令归政英宗，并无丝毫贪恋权势的想法。
