多年来，反对者认为转基因植物对人类健康和自然造成了极大伤害，并指责植物生物技术公司，如孟山都（注：该公司已经被德国企业收购），把追逐利润置于人性之上。
然而，农业生物技术支持者认为，基因工程作物使农民能够在全球食品短缺、害虫横虐、杂草丛生及极端天气的条件下种植。
这是一个复杂的问题。密苏里州的圣路易斯唐纳德植物中心总裁、植物病毒学家罗杰•比奇认为，环保主义者和生物技术专家可以求同存异，共同走向绿色目标。
1、生物改良大豆
1994年5月，美国孟山都公司培育的抗草甘膦除草剂转基因大豆首先获准在美国商业化种植，1997年杜邦公司获得美国食品药物管理局批准推广种植高油酸(70%)转基因大豆。转基因不仅没有增加除草剂的施用量，还减少了除草剂的施用量，且有助于采用保护性耕作和采用窄行间距种植，从而达到增产的目的。
2、食用的棉花种子
天然的棉花种子是不能吃的，因为它们含有具有*虫功能的棉子酚。它有毒，可通过抑制精子活动来使人暂时不育。2006年德州农工大学和棉花公司合作，应用基因工程技术，研究出去除棉子酚的棉花种子，同时该成分在植株中得以保留以对植株提供保护。这种棉花种子可用于做面粉，但是在这项研究能成为现实之前，还要克服很多监管和物流的障碍。
3、麻疯树
麻疯树是一种不可食用的植物，它的种子能够生产生物燃料。2012年初，麻疯树在印度引发了政治紧张,部落社区指责政府为了燃料需求，摧毁了他们的原生作物而种植麻风树。转基因技术可研发高产量的麻疯树从而减少种植面积。麻疯树以及其他的产油、非食用作物还具有生产生物塑料的潜能，而生物塑料可以自然降解。
4、黄金大米
