▲沙捞越王朝的扩张过程（动图）
至此，文莱苏丹终于看清了英国人的野心，把北方的沙巴州租借给美国人，以平衡英国人的势力。但美国政府无意插手此事，只让美国人以私人名义租下沙巴州。结果由于经营不善，沙巴州的租界权最后还是落到了英国人手上，属于另一家英国殖民公司，与布鲁克家族无关。
▲沙捞越王国是个实质性的独立王国，连国旗都有
1888年，文莱被英国强迫签署协议，正式沦为英国殖民地，沙捞越和沙巴两州脱离文莱。而文莱的疆域从当初的整个加里曼丹岛缩减到了岛北部很小的一块。
在此之前的1874年，英国已经把马来半岛变成殖民地，再加上从文莱分割出来的加里曼丹岛两个州，未来将构成现代马来西亚的基础。不过，此时的文莱还是一整块，后来归属马来西亚的林梦地区尚没有被割走。
1890年，就是这个林梦地区又发生叛乱，布鲁克家族抢先动手镇压，随即宣布兼并此地。文莱苏丹这回总算清醒了，坚决不承认布鲁克家族对林梦地区的侵略。但文莱剩余的国土事实上被一分为二，连陆地通道都没有。
▲林梦地区在文莱东西两部分之间，彻底截断了陆上通道
布鲁克家族并没有就此罢手，仍在图谋残余的文莱国土。1899年，在布鲁克家族的鼓动下，文莱最后两块领地也发生叛乱，布鲁克家族已经准备好如法炮制，进一步蚕食文莱。如果再次成功，文莱将会变得比现在更小，可能只剩下苏丹王宫所在的都城。
正在这时，文莱近海突然发现了石油。以内燃机和电力为代表的第二次工业革命已经展开，石油一下子拥有了极其重要的战略地位。英国政府出于全球争霸的需要，不希望油田掌握私人手里。
▲19世纪末，欧洲列强才真正完成对东南亚的殖民
而布鲁克家族一直是以私人名义统治沙捞越的，经常对英国政府的要求和命令阳奉阴违，妨碍英国殖民政策的贯彻执行。于是，英国政府借口石油资源必须由英国掌控，制止了布鲁克家族对文莱的侵吞，改为对文莱进行直接控制。
1906年，英国政府全面接管文莱的统治权，苏丹沦为了傀儡。尽管如此，苏丹仍然不肯承认林梦地区的沦丧，使该地成为将来独立后的争议地区。
四、文莱独立
除了日本人在二战期间短暂统治过几年外，文莱一直是英国的殖民地。二战后，民族解放运动高涨，英国无力再维持庞大的海外殖民地，整个马来地区开始谋划成立独立国家。
马来半岛的英国殖民地在1957年成立“马来亚联合邦”，取得一定的自治权，并积极寻求与新加坡、加里曼丹岛两州和文莱，组成独立的马来国家。除了新加坡以华人为主外，马来人在其他几个地方都占有很大优势。
