▲持海尔维第共和国三色旗的旗手
法国推行的中央集权制度，遭到了大多数瑞士人民的反对，但也有少数人愿意服从集权制度。瑞士开始出现了支持集权的“统一派”和主张地方自治的“联邦主义者”两大派。
双方最后经过协商，在拿破仑的主导下，瑞士成为了联邦国家，废除海尔维第共和国，并形成了一部各州之间权力平衡、州与联邦权力平衡的新宪法。但是这个时候为了兼顾各州的利益，首都实行轮换制度。
拿破仑战争失败后，1815年欧洲各国在维也纳召开会议。为了削弱法国的实力，战胜国同意将汝拉州、日内瓦州和纳沙泰尔州等讲法语的地区划归瑞士，这使得瑞士的法语人口大幅度增加，自此瑞士的疆域固定下来。
▲维也纳会议上，瑞士被确立为永久中立国
三、从邦联到联邦，建都伯尔尼
对于习惯了地方自治的瑞士人来说，1789年法国大革命前的瑞士邦联制度，尽管有利于维护地方各州的权利，但是在碰到外交困境的时候，邦联体制下弱小的中央政府难以发挥任何作用。
为了能够更好的协调与周边林立的强国的关系，1815年，瑞士制定了一部维护瑞士联邦制度的宪法，意味着瑞士开始从邦联制走向联邦制。但这部宪法在中央和地方权力分配方面，还是侧重于维护地方。
瑞士的十几个新教州在经济等方面远远好于7个天主教州，部分保守的天主教州感到自己在联邦中受到了不公平的对待，想要从联邦中分离出去。
▲1847年的“独立联盟战争”，联邦派获得胜利
从1830年开始，瑞士的保守派（天主教）与革新派（新教）又进行了长达18年的争斗。最终代表全国80%人口和经济最发达地区的新教州取得了胜利。
这次战争让瑞士各州看到一个软弱联邦政府的无力，因而各州同意战后在保证各州自治权的同时，强化联邦政府的权力。1848年革命后，瑞士制定了一部联邦宪法。
正式确立联邦制后，瑞士联邦议会就首都问题展开了讨论。他们经过讨论，决定废除1803年开始的首都轮换制度，并建立一个新的首都，作为联邦政府的办公地。
作为一个处在德法意三大民族之间的中立国家，瑞士在首都的选择上要兼顾国内外各方面的利益，也要坚持分权平衡的传统。在全国26个州中，新教州占据多数，以德语为官方语言的州占了17个。在各州投票选拔首都的时候，会偏向讲德语的州。
▲瑞士语言分布区
瑞士联邦最初确立了苏黎世、伯尔尼和卢塞恩这三个属于德语区的城市作为首都的备选。
苏黎世当时不论是从基础设施还是经济发展以及在世界上的声誉，都是首都当之无愧的选择。但在强调地方自治的联邦主义者认为，苏黎世当选不利于各州的平衡，苏黎世太强大，会强化优势城市的地位。
