《瓦力欧大陆4》甚至加入了“银行战士”系列的倒计时和冲刺跑
双喜临门
因为空档太久，《银河战士：融合》将成为很多玩家接触的第一款“银河战士”作品。团队中的新人也觉得《超级银河战士》难度偏高，新作需要降低门槛。本作因此加入大量引导流程的插图和对话，主角萨姆斯也会在独白文字中谈论内心感受，这些设计和系列之前的思路大相径庭。
萨姆斯的内心独白
坂本贺勇说，《超级银河战士》没有加入大量插图和对话，并非受限于卡带容量，而是刻意为之。当年他想尝试完全利用游戏关卡进行叙事和引导，最终的成品独具匠心，但也提高了游戏的门槛。《银河战士：融合》的开发目标是降低门槛，因此放弃了系列的传统。
考虑到GBA的按键少于SFC，在新人开发者的建议下，《银河战士：融合》的操作得到了简化，玩家只要按R键就可以切换到导弹，无需通过Select键切换武器。本作还取消了冲刺键，当萨姆斯的速度不断提升时就会自动进入冲刺状态。攀爬墙壁和天花板是本作新加入的能力，给玩家探索地图提供了便利。
攀爬天花板的萨姆斯
如果《银河战士：融合》的变化仅限于此，那它只能成为一款简化缩水版《超级银河战士》，可以满足新玩家，却对不起老玩家长久的等待。本作在降低通关门槛的同时，也保障了全收集的难度，100%收集率通关对玩家而言依然颇具挑战性。另一方面，本作的创新元素也令人眼前一亮。
为了给老玩家带来新感觉，团队将萨姆斯的强化服从传统的金色变为蓝色，坂本贺勇批准了这一更改，但他认为《银河战士：融合》需要在剧情和系统方面给换色做出理由，为此他修改了剧本细节。
在本作的开场剧情中，萨姆斯的强化服依然是传统的金色，随后，强化服被新登场的寄生体生物X同化，萨姆斯被注射宇宙生物密特罗德的细胞后才逃过一劫，强化服因此变成了蓝色，但也失去了之前的大部分能力。在系列之前的作品中，萨姆斯在游戏初期会失去上一作的能力，被迫重新收集道具，之前的剧情对此没有解释，《银河战士：融合》则给出了一个合理的设定。
另一方面，寄生在强化服上的X可以复制宿主的能力，变成了一个金色的拟态生物SA-X，这个模仿者拥有之前萨姆斯的强大能力，假货的实力暂时超越了本尊。在游戏后期恢复大部分能力之前，萨姆斯无法正面打败SA-X，只能避其锋芒。
萨姆斯躲避SA-X的巡逻
SA-X突然闯入画面的时刻，也是玩家最紧张的时刻，随着SA-X步步逼近，其脚步声也清晰可闻。玩家在前期只需单纯躲藏就可以度过危险，在后期，SA-X会破坏场景里的掩体，逼迫玩家夺路狂奔。这种体验是《超级银河战士》所不曾有的，也让《银河战士：融合》具备了足够的创新魅力。
《银河战士：融合》的欧版于2002年11月22日发售，仅比美版晚了几天。日版玩家则要等到2003年2月14日，这一天也是日版GBA SP（GBA的升级版掌机）的首发时间，任天堂为日版准备了特殊配色的限定版GBA SP。日版游戏加入了难度选择和新的结局插图，这些插图由日本漫画家石川坚士执笔，素材源自同期在日本杂志上连载的漫画版《银河战士》。
